在脱硫除尘器运行时，体内的气流会形成涡流，涡流一旦形成几乎是无法消除的，特别是遇到含尘气体温度变化、速度变化以及管壁可能形成的结露等，就需要对除尘管道进行定期清扫。脱硫除尘器清扫孔的位置应在管道的侧面或上部，所有清扫孔都必须做到严密不漏风。
由于脱硫除尘器单位耗钢量比较大，因此在安装上比较好的方法是从筒身上部向下材料由厚向薄逐渐！这样比较好维护！
脱硫塔浆液起泡问题跟脱硫系统的杂质和运行方式紧密相关，浆液起泡溢流后对CGH和增压风机的安全运行影响巨大，值得发电厂引起足够的重视。在脱硫旁路取消后，起泡几率将增加，需要从液位监测手段和运行方式上进行适当改进，才能降低系统起泡溢流的次数。脱硫塔起泡后重要的是防止浆液倒灌入原烟气侧影响增压风机和CGH等设备，运行操作上可以停运1台浆液循环泵，或停运1台氧化风机，以减小吸收塔内部浆液的扰动，同时将塔内浆液打入事故浆液箱暂存，降低塔内杂质浓度。液位降低后，开启除雾器进行冲洗。实践证明，新鲜工艺水通过除雾器冲洗补入吸收塔具有良好的消泡效果。
